60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2187 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  897    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  59.9 
 
 		 434 aa  522  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  58.56 
 
 		 485 aa  476  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  40 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  36.82 
 
 		 424 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  37.5 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  36.62 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  35.64 
 
 		 396 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  33.33 
 
 		 394 aa  206  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  34.69 
 
 		 381 aa  206  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  31.63 
 
 		 411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  34.41 
 
 		 385 aa  197  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  33.87 
 
 		 383 aa  193  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  33.33 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  32.9 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  33.7 
 
 		 386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  32.88 
 
 		 384 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  34.36 
 
 		 416 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  35.81 
 
 		 375 aa  189  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  31.88 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  36.19 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  33.42 
 
 		 383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  30.47 
 
 		 393 aa  183  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  31.85 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  32.97 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  32.97 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  33.7 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  32.63 
 
 		 385 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  30.21 
 
 		 388 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  32 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  31.72 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  32.17 
 
 		 387 aa  170  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  30.05 
 
 		 416 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  30.31 
 
 		 416 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  30.31 
 
 		 416 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  34.25 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  29.4 
 
 		 409 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  32.79 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  29.66 
 
 		 429 aa  163  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  30.79 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  34.06 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  31.73 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  31.7 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  30.73 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  29.64 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  31.16 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  31.16 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  28.31 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  32.65 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  30.9 
 
 		 389 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  29.57 
 
 		 383 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  26.65 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  25.61 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1491  hypothetical protein  26.64 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  30.05 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  24.62 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  26.18 
 
 		 336 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  27.97 
 
 		 533 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  26.94 
 
 		 3045 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  23.51 
 
 		 389 aa  43.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0754602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>