58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3642 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  794    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  47.29 
 
 		 388 aa  355  5.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  44.97 
 
 		 388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  41.69 
 
 		 387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  40.58 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  38.66 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  35.96 
 
 		 485 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  34.9 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  31.68 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  33.94 
 
 		 416 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  33.68 
 
 		 416 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  33.68 
 
 		 416 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  33.33 
 
 		 435 aa  195  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  30.63 
 
 		 409 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  33.08 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  30.45 
 
 		 419 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  33.42 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  31.52 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  30.99 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  31.18 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  30.41 
 
 		 422 aa  169  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  32.17 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  31.65 
 
 		 424 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  31.43 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  32.27 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  33.42 
 
 		 382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  31.5 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  29.64 
 
 		 393 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  31.05 
 
 		 390 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  29.74 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  30.24 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  31.58 
 
 		 383 aa  149  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  33.6 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  28.41 
 
 		 386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  29.84 
 
 		 386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  29.03 
 
 		 381 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  29.57 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  29.57 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  29.57 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  31.36 
 
 		 385 aa  143  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  28.76 
 
 		 381 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  29.82 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  28.61 
 
 		 383 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  27.57 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  26.87 
 
 		 423 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  28.7 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  29.5 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  25.72 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  25.72 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  24.43 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  25.46 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  25.72 
 
 		 389 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  26.05 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  25 
 
 		 388 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  33.33 
 
 		 542 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  28.57 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  23.97 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.22 
 
 		 695 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>