62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2635 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  680    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  86.75 
 
 
374 aa  599  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  64.02 
 
 
386 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  61.14 
 
 
383 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  61.21 
 
 
383 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  61.21 
 
 
383 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  61.21 
 
 
384 aa  421  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  64.31 
 
 
382 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  60.3 
 
 
381 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  59.64 
 
 
381 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  58.75 
 
 
385 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  54.29 
 
 
375 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  51.05 
 
 
386 aa  348  7e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  40.98 
 
 
379 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  38.32 
 
 
427 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  36.28 
 
 
383 aa  186  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  37.5 
 
 
391 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  35.8 
 
 
485 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  34.46 
 
 
381 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  34.65 
 
 
383 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  31.78 
 
 
434 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  33.64 
 
 
419 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  34.72 
 
 
390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  33.33 
 
 
409 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  33.33 
 
 
435 aa  159  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  32.05 
 
 
396 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  32.31 
 
 
416 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  32.31 
 
 
416 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  32 
 
 
416 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  31.64 
 
 
383 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  31.52 
 
 
397 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  34.5 
 
 
388 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  34.77 
 
 
424 aa  149  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  34.46 
 
 
411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  33.23 
 
 
387 aa  146  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  33.74 
 
 
422 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  29.32 
 
 
388 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  31.72 
 
 
424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  31.21 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  30.41 
 
 
429 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  31.15 
 
 
385 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  34.87 
 
 
376 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  29.5 
 
 
394 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  32.63 
 
 
416 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  32.72 
 
 
412 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  28.34 
 
 
423 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  30.84 
 
 
393 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  27.54 
 
 
403 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  28.7 
 
 
389 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  28.7 
 
 
389 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  28.4 
 
 
389 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  27.95 
 
 
389 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  27.56 
 
 
388 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  25.58 
 
 
336 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1491  hypothetical protein  26.91 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  22.9 
 
 
437 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  25.87 
 
 
461 aa  50.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2244  sulfotransferase  26.01 
 
 
315 aa  49.3  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00315501  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  23.4 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  25.82 
 
 
362 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  27.05 
 
 
266 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  25.1 
 
 
533 aa  42.7  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>