59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5227 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  93.39 
 
 
383 aa  738    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  795    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  92.39 
 
 
381 aa  738    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  92.95 
 
 
383 aa  741    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  92.95 
 
 
383 aa  741    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  76.19 
 
 
384 aa  608  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  63.23 
 
 
385 aa  508  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  63.83 
 
 
386 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  61.9 
 
 
382 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  57.33 
 
 
374 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  60.3 
 
 
334 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  52.93 
 
 
386 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  49.2 
 
 
375 aa  361  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  35.69 
 
 
379 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  33.15 
 
 
427 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  32.52 
 
 
434 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  32.45 
 
 
383 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  31.37 
 
 
485 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  33.33 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  32.09 
 
 
387 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  33.33 
 
 
388 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  32.36 
 
 
391 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  33.94 
 
 
397 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  31.54 
 
 
435 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  30.89 
 
 
424 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  30.77 
 
 
383 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  31.5 
 
 
381 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  31.41 
 
 
411 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  31.47 
 
 
409 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  32.63 
 
 
383 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  31.08 
 
 
390 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  32.87 
 
 
424 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  31.2 
 
 
419 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  31.82 
 
 
416 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  31.82 
 
 
416 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  31.82 
 
 
416 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  29.55 
 
 
422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  29.03 
 
 
394 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  29.62 
 
 
385 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  32.27 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  29.26 
 
 
429 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  27.15 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  31.34 
 
 
376 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  27.32 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  35.27 
 
 
416 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  28.73 
 
 
423 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  28.61 
 
 
403 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  27.25 
 
 
393 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  27.88 
 
 
389 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  27.88 
 
 
389 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  27.99 
 
 
389 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  26.65 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  26.44 
 
 
388 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  24.61 
 
 
461 aa  63.2  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  23.86 
 
 
437 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  24.8 
 
 
341 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3131  hypothetical protein  22.15 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242131  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  19.71 
 
 
281 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  23.68 
 
 
336 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>