57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4230 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  865    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  43.27 
 
 		 416 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  37.41 
 
 		 422 aa  263  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  35.31 
 
 		 409 aa  230  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  38.44 
 
 		 424 aa  229  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  34.41 
 
 		 419 aa  229  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  33.94 
 
 		 416 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  33.68 
 
 		 416 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  37.84 
 
 		 429 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  33.68 
 
 		 416 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  37.43 
 
 		 385 aa  193  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  29.79 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  27.08 
 
 		 427 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  27.63 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  28.97 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  29.22 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  27.6 
 
 		 434 aa  136  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  27.39 
 
 		 393 aa  136  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  29.29 
 
 		 387 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  29.61 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  26.87 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  29.79 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  29.92 
 
 		 384 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  29.37 
 
 		 383 aa  123  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  31.34 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  27.51 
 
 		 375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  30.25 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  28.15 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  25.4 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  26.01 
 
 		 435 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  27.53 
 
 		 383 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  30.89 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  28.35 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  28.42 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  28.16 
 
 		 386 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  28.93 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  28.73 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  28.34 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  28.73 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  28.65 
 
 		 383 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  28.65 
 
 		 383 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  28.38 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  27.59 
 
 		 385 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  28.83 
 
 		 391 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  25.93 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  25.58 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  25.58 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  24.5 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  25.58 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  26.07 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  27.24 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  23.48 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  23.06 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1491  hypothetical protein  26.4 
 
 		 360 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  22.22 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  22.92 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  25.98 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>