56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3642 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  865    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  51.45 
 
 
416 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  40.73 
 
 
409 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  40.95 
 
 
424 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  39.57 
 
 
416 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  39.81 
 
 
416 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  39.81 
 
 
416 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  40.15 
 
 
419 aa  288  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  40.58 
 
 
429 aa  275  8e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  37.41 
 
 
423 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  42.15 
 
 
385 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  32.2 
 
 
427 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  31.25 
 
 
396 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  34.54 
 
 
390 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  32.46 
 
 
485 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  32.21 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  30.91 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  32.73 
 
 
391 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  30.41 
 
 
394 aa  169  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  31.16 
 
 
393 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  31.47 
 
 
381 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  32.1 
 
 
383 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  31.48 
 
 
374 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  30.35 
 
 
388 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  30.73 
 
 
387 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  31.85 
 
 
384 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  29.53 
 
 
435 aa  153  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  31.05 
 
 
379 aa  153  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  29.55 
 
 
381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  31.51 
 
 
386 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  33.59 
 
 
383 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  32.87 
 
 
412 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  28.68 
 
 
388 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  30.08 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  33.74 
 
 
334 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  30.49 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  28.42 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  28.42 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  30.55 
 
 
382 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  27.98 
 
 
381 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  28.16 
 
 
383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  30.9 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  29.53 
 
 
424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  29.82 
 
 
386 aa  131  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  30.34 
 
 
375 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  30.4 
 
 
389 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  30.4 
 
 
389 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  30.15 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  28.8 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  27.32 
 
 
393 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  25.67 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  24.58 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  25 
 
 
389 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  26.88 
 
 
336 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3131  hypothetical protein  21.84 
 
 
403 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242131  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  23.97 
 
 
437 aa  43.1  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>