60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3480 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  811    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  34.04 
 
 
383 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  33.68 
 
 
381 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  31.79 
 
 
427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  33.07 
 
 
485 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  32.9 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  32.31 
 
 
390 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  30.55 
 
 
416 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  30.55 
 
 
416 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  31.77 
 
 
434 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  30.55 
 
 
416 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  31.88 
 
 
383 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  30.2 
 
 
424 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  30.21 
 
 
435 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  30.03 
 
 
419 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  31.16 
 
 
422 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  29.29 
 
 
409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  29.83 
 
 
411 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  28.95 
 
 
379 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  29.64 
 
 
394 aa  159  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  30.99 
 
 
396 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  30.21 
 
 
386 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  30.18 
 
 
383 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  27.72 
 
 
424 aa  149  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  31.44 
 
 
382 aa  146  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  28.61 
 
 
397 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  30.65 
 
 
374 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  28.61 
 
 
388 aa  143  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  28.17 
 
 
416 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  28.68 
 
 
384 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  28 
 
 
388 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  27.39 
 
 
423 aa  136  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  28.5 
 
 
386 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  31.21 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  29.57 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  29.14 
 
 
375 aa  133  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  30.77 
 
 
385 aa  133  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  27.74 
 
 
383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  27.74 
 
 
383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  28.53 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  28.68 
 
 
381 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  27.76 
 
 
383 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  27.32 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  27.84 
 
 
429 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  30.59 
 
 
412 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  27.46 
 
 
393 aa  116  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  26.6 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  26.32 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  25.45 
 
 
389 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  25.45 
 
 
389 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  25 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  25.19 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  25.17 
 
 
388 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  26.98 
 
 
437 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  22.61 
 
 
346 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  23.94 
 
 
461 aa  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  23.56 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  28.35 
 
 
3045 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  22.94 
 
 
336 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  22.78 
 
 
336 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>