56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1960 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  877    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  79.68 
 
 
385 aa  621  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  47.91 
 
 
409 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  48.88 
 
 
419 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  45.57 
 
 
424 aa  345  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  45.64 
 
 
416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  45.64 
 
 
416 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  45.64 
 
 
416 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  41.29 
 
 
416 aa  295  8e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  40.58 
 
 
422 aa  275  8e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  37.84 
 
 
423 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  36.89 
 
 
396 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  35.71 
 
 
397 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  30.19 
 
 
427 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  31.3 
 
 
485 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  33.08 
 
 
394 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  31.59 
 
 
388 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  32.89 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  31.65 
 
 
388 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  28.91 
 
 
434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  29.4 
 
 
435 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  32.28 
 
 
383 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  29.57 
 
 
411 aa  156  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  31.04 
 
 
381 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  28.23 
 
 
379 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  32.16 
 
 
374 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  31.17 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  32.45 
 
 
391 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  32.03 
 
 
390 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  29.78 
 
 
424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  31.06 
 
 
383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  29.49 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  29.22 
 
 
383 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  29.22 
 
 
383 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  31.69 
 
 
383 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  28.49 
 
 
381 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  27.84 
 
 
386 aa  137  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  29.26 
 
 
381 aa  136  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  28.77 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  29.14 
 
 
384 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  32.22 
 
 
412 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  30.41 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  28.46 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  27.84 
 
 
393 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  29.33 
 
 
375 aa  127  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  30.56 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  30.56 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  30.03 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  28.53 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  29.51 
 
 
389 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  26.53 
 
 
376 aa  94  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  22.77 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  27 
 
 
389 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  24.05 
 
 
437 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  23.13 
 
 
336 aa  50.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  21.6 
 
 
281 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>