53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4401 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  802    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  53.55 
 
 
389 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  53.55 
 
 
389 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  53.05 
 
 
389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  52.54 
 
 
389 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  33 
 
 
403 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  32.08 
 
 
485 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  30.73 
 
 
435 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  31.75 
 
 
434 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  33.84 
 
 
391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  27.93 
 
 
427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  30.83 
 
 
390 aa  133  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  30.71 
 
 
381 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  29.72 
 
 
383 aa  123  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  29.05 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  30.37 
 
 
397 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  28.79 
 
 
416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  28.79 
 
 
416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  28.79 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  28.53 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  27.46 
 
 
393 aa  116  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  28.54 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  29.06 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  28.5 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  28.76 
 
 
383 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  28.76 
 
 
383 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  29.29 
 
 
383 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  28.53 
 
 
424 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  29.37 
 
 
376 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  27.32 
 
 
422 aa  106  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  27.78 
 
 
419 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  31.32 
 
 
385 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  27.51 
 
 
381 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  27.89 
 
 
416 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  28.17 
 
 
384 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  27.25 
 
 
381 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  30.29 
 
 
374 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  30.84 
 
 
334 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  26.62 
 
 
379 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  30.04 
 
 
382 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  25.81 
 
 
388 aa  97.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  28.98 
 
 
386 aa  96.7  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  25.25 
 
 
388 aa  96.3  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  28.15 
 
 
386 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  24.43 
 
 
394 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  27.3 
 
 
383 aa  87  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  25.94 
 
 
383 aa  86.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  25.51 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  24.5 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  26.58 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  24.37 
 
 
387 aa  77  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  32.83 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  22.35 
 
 
437 aa  50.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>