64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5540 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  824    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  33.84 
 
 		 485 aa  219  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  32.34 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  32.29 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  35.33 
 
 		 411 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  30.28 
 
 		 435 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  33 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  33.42 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  36.72 
 
 		 382 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  31.72 
 
 		 388 aa  172  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  33.14 
 
 		 424 aa  169  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  32.02 
 
 		 381 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  34.22 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  32.18 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  34.23 
 
 		 386 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  33.42 
 
 		 416 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  33.79 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  32.63 
 
 		 397 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  33.15 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  33.15 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  33.6 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  31.75 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  32.71 
 
 		 381 aa  159  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  32.18 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  32.18 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  31.47 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  32.38 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  33.53 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  32.87 
 
 		 422 aa  156  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  30.73 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  32 
 
 		 384 aa  153  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  34.21 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  33.07 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  30.73 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  30.59 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  33.99 
 
 		 376 aa  146  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  32.52 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  32.72 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  30.67 
 
 		 391 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  31.54 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  31.9 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  33.86 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  29.46 
 
 		 379 aa  126  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  28.42 
 
 		 416 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  30.89 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  28.9 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  29.39 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  27.11 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  26.17 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  26.46 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  26.46 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  26.46 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  25.95 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  25.78 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  27.81 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  27.27 
 
 		 347 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  25.78 
 
 		 346 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  25.1 
 
 		 336 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  23.36 
 
 		 461 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  22.13 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  24.83 
 
 		 389 aa  49.7  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  27.56 
 
 		 266 aa  46.6  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  26.46 
 
 		 3045 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  23.86 
 
 		 536 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>