39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1491 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1491  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  716    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0918  hypothetical protein  61.67 
 
 
312 aa  350  3e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.800878 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  28.76 
 
 
336 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  27.37 
 
 
437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  28.01 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  24.61 
 
 
388 aa  106  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  25.63 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  24.65 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  25.61 
 
 
386 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  25.72 
 
 
411 aa  63.2  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  28.04 
 
 
386 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  26.98 
 
 
374 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  24.51 
 
 
416 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  24.51 
 
 
416 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  24.12 
 
 
416 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3251  hypothetical protein  27.1 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  26.04 
 
 
382 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  26.25 
 
 
435 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0299  hypothetical protein  29.05 
 
 
307 aa  57  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.112405  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  26.91 
 
 
334 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  25.89 
 
 
396 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  23.23 
 
 
434 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  24.03 
 
 
485 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  26.4 
 
 
423 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  23.97 
 
 
379 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  31.3 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  24.12 
 
 
390 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  24.58 
 
 
424 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  21.22 
 
 
391 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  22.44 
 
 
397 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  24.82 
 
 
383 aa  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  23.7 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  22.63 
 
 
519 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  21.89 
 
 
393 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3111  sulfotransferase  27.27 
 
 
329 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  19.77 
 
 
388 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  22.76 
 
 
381 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  22.93 
 
 
409 aa  43.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  25.93 
 
 
383 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>