18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3111 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3111  sulfotransferase  100 
 
 
329 aa  650    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  30 
 
 
379 aa  55.8  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3108  sulfotransferase  24.29 
 
 
370 aa  52.8  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0854  sulfotransferase  30.51 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  29.84 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1491  hypothetical protein  27.27 
 
 
360 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  31.71 
 
 
386 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0517  sulfotransferase  27.6 
 
 
274 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1481  sulfotransferase  22.34 
 
 
427 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  27.27 
 
 
437 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  24.82 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  25.74 
 
 
389 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  27.7 
 
 
525 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1278  sulfotransferase  25.52 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2693  hypothetical protein  24.36 
 
 
311 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0792  hypothetical protein  27.52 
 
 
288 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.565262  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  43.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4582  sulfotransferase  25.9 
 
 
280 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>