27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3251 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3251  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  660    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0299  hypothetical protein  41.26 
 
 
307 aa  204  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.112405  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0892  SecC motif-containing protein  27.15 
 
 
342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1176  SecC motif-containing protein  28.97 
 
 
359 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1264  SecC motif-containing protein  27.59 
 
 
336 aa  106  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00874366  hitchhiker  0.00404775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0792  hypothetical protein  32.92 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.565262  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1760  hypothetical protein  31.6 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.50844  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1491  hypothetical protein  27.1 
 
 
360 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2244  sulfotransferase  30.37 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00315501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  26.19 
 
 
437 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  31.21 
 
 
625 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  30.4 
 
 
531 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0738  hypothetical protein  24.51 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5968  hypothetical protein  30 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258311  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3108  sulfotransferase  27.23 
 
 
370 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
2762 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  30.83 
 
 
524 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3105  sulfotransferase  24.91 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1400  hypothetical protein  30.37 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.527187  hitchhiker  0.00390596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  23.65 
 
 
624 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1830  hypothetical protein  22.66 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  32.76 
 
 
546 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1180  hypothetical protein  23.73 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
1406 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04479  putative sulfotransferase required for AvrXa21 activity ST (raxST)  25.11 
 
 
280 aa  43.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  23.53 
 
 
266 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3924  sulfotransferase  25.96 
 
 
314 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0563915  normal  0.391317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>