63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4373 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  799    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  57.33 
 
 
386 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  55.15 
 
 
385 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  56.06 
 
 
382 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  52.93 
 
 
381 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  52.88 
 
 
384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  51.33 
 
 
383 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  51.33 
 
 
383 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  50.8 
 
 
381 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  51.33 
 
 
383 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  50.79 
 
 
374 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  51.05 
 
 
334 aa  348  8e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  44.02 
 
 
375 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  36.36 
 
 
379 aa  226  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  34.78 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  34.25 
 
 
485 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  34.46 
 
 
383 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  31.34 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  34.22 
 
 
397 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  34.19 
 
 
411 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  32.13 
 
 
396 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  33.88 
 
 
388 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  32.29 
 
 
381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  31.1 
 
 
388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  32.71 
 
 
383 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  31.88 
 
 
435 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  30.21 
 
 
393 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  30.03 
 
 
424 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  31.81 
 
 
391 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  33.04 
 
 
383 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  33.06 
 
 
387 aa  149  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  33.51 
 
 
424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  31.51 
 
 
422 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  32.98 
 
 
412 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  29.84 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  30.17 
 
 
409 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  30.45 
 
 
419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  31.68 
 
 
390 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  32.96 
 
 
376 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  29.64 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  31.48 
 
 
416 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  31.01 
 
 
416 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  31.01 
 
 
416 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  28.77 
 
 
429 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  28.16 
 
 
423 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  28.99 
 
 
416 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  27.9 
 
 
403 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  28.38 
 
 
389 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  28.65 
 
 
389 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  28.65 
 
 
389 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  28.04 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  28.15 
 
 
393 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1491  hypothetical protein  25.52 
 
 
360 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  23.72 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  24.9 
 
 
388 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  25.29 
 
 
536 aa  57.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  24.91 
 
 
389 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  26.09 
 
 
437 aa  53.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  26.58 
 
 
461 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  23.49 
 
 
533 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  23.76 
 
 
362 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  23.08 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  25.82 
 
 
346 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>