56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0373 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  825    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  37.27 
 
 		 389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  35.66 
 
 		 389 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  35.66 
 
 		 389 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  35.14 
 
 		 389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  34.01 
 
 		 393 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  33.93 
 
 		 485 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  35.12 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  29.7 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  31.99 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  27.7 
 
 		 424 aa  141  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  31.12 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  30.03 
 
 		 394 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  28.53 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  29.73 
 
 		 388 aa  136  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  28.57 
 
 		 381 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  33.53 
 
 		 391 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  29.33 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  27.48 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  27.81 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  29.01 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  27.63 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  26.7 
 
 		 409 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  28.21 
 
 		 376 aa  120  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  28.8 
 
 		 375 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  25.56 
 
 		 397 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  32.11 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  28.29 
 
 		 374 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  30.91 
 
 		 416 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  28.92 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  27.98 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  27.68 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  30.43 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  25.96 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  28.25 
 
 		 386 aa  110  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  28.47 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  28.18 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  26.14 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  28.18 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  26.14 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  26.14 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  28.98 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  28.27 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  28.14 
 
 		 334 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  24.39 
 
 		 387 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  25.19 
 
 		 379 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  24.74 
 
 		 383 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  26.84 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  25 
 
 		 383 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  25.64 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  23.56 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  23.79 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  26.6 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  22.02 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  22.39 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  20.25 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>