61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6396 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  780    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  60.1 
 
 
383 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  56.54 
 
 
383 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  36.31 
 
 
485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  32.25 
 
 
427 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  33.68 
 
 
393 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  32.87 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  34.14 
 
 
435 aa  192  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  36.39 
 
 
396 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  34.08 
 
 
424 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  35.95 
 
 
397 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  33.15 
 
 
374 aa  185  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  34.77 
 
 
382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  31.99 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  33.42 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  30 
 
 
386 aa  177  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  33.69 
 
 
388 aa  176  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  34.46 
 
 
334 aa  173  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  31.18 
 
 
394 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  30.95 
 
 
424 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  31.64 
 
 
409 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  32.35 
 
 
416 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  32.35 
 
 
416 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  32.35 
 
 
416 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  34.6 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  32.64 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  32.84 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  31.52 
 
 
384 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  32.29 
 
 
386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  30.81 
 
 
419 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  31.47 
 
 
422 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  31.5 
 
 
381 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  34.04 
 
 
383 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  31.42 
 
 
381 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  29.44 
 
 
383 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  31.3 
 
 
375 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  31.88 
 
 
385 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  33.43 
 
 
391 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  29.44 
 
 
383 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  29.44 
 
 
383 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  31.04 
 
 
429 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  29.57 
 
 
379 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  31.9 
 
 
416 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  31.72 
 
 
412 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  30.71 
 
 
393 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  28.32 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  28.32 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  28.57 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  28.9 
 
 
376 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  27.83 
 
 
389 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  27.89 
 
 
389 aa  112  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  28.35 
 
 
423 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  23.1 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  25.38 
 
 
388 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  27.83 
 
 
461 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  22.05 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4121  sulfotransferase  24.09 
 
 
281 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  24.39 
 
 
437 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  21.97 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  30.89 
 
 
389 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  25.42 
 
 
362 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>