14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1965 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1965  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  633  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.763325  normal  0.0611171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1839  amino acid adenylation domain protein  25.32 
 
 		 1470 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1865  amino acid adenylation domain protein  25.32 
 
 		 1470 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  25.65 
 
 		 2762 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  26.2 
 
 		 3045 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1697  CurM  24.06 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778957  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30000  polyketide synthase  23.43 
 
 		 18193 aa  62.8  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3552  sulfotransferase  23.19 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0188645 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3924  sulfotransferase  21.67 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0563915  normal  0.391317 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0641  sulfotransferase  23.95 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  24.27 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  25.93 
 
 		 533 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 1037 aa  46.2  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  30.58 
 
 		 424 aa  43.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>