59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0784 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
709 aa  1457    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  31.76 
 
 
899 aa  207  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  32.05 
 
 
889 aa  203  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  31.47 
 
 
578 aa  95.1  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  28.88 
 
 
663 aa  87.8  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.22 
 
 
1764 aa  87.4  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  31.84 
 
 
546 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  28.91 
 
 
700 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  26.16 
 
 
656 aa  84  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  27.76 
 
 
531 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  28.63 
 
 
652 aa  81.6  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
1406 aa  81.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  27.88 
 
 
669 aa  79.7  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  27.61 
 
 
637 aa  77.4  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28 
 
 
695 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  29.41 
 
 
524 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  25.31 
 
 
673 aa  75.5  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  28.78 
 
 
720 aa  73.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
697 aa  73.9  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  26.59 
 
 
548 aa  73.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  28.02 
 
 
677 aa  72.4  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  26.41 
 
 
624 aa  71.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  27.72 
 
 
527 aa  70.5  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  25 
 
 
634 aa  70.1  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  31 
 
 
725 aa  69.7  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  28.57 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  28.81 
 
 
717 aa  68.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  29.35 
 
 
542 aa  65.1  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  25.1 
 
 
762 aa  64.7  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.1 
 
 
762 aa  64.7  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
573 aa  63.9  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  23.56 
 
 
549 aa  63.9  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  26.37 
 
 
604 aa  63.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
530 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  29.21 
 
 
530 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  26.89 
 
 
636 aa  62  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 
538 aa  61.6  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  23.83 
 
 
542 aa  60.1  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  29.17 
 
 
532 aa  59.7  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  25.23 
 
 
488 aa  58.9  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  22.1 
 
 
533 aa  58.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  25.59 
 
 
648 aa  58.5  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  25.76 
 
 
536 aa  58.2  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  25.27 
 
 
626 aa  57  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  28.02 
 
 
670 aa  56.6  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 
685 aa  55.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  23.28 
 
 
525 aa  54.7  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  24.75 
 
 
519 aa  54.3  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  25 
 
 
529 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  26.78 
 
 
594 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22840  sulfotransferase  21.15 
 
 
328 aa  52  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  23.41 
 
 
625 aa  51.6  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1937  hypothetical protein  20.99 
 
 
394 aa  51.2  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314612  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  24.39 
 
 
614 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 
713 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  23.97 
 
 
307 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
510 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  22.07 
 
 
266 aa  44.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0892  SecC motif-containing protein  25.74 
 
 
342 aa  43.9  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>