121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4327 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 899 aa  1878    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  67.54 
 
 		 889 aa  1229    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 697 aa  227  7e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.74 
 
 		 1764 aa  223  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 		 1406 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  35.29 
 
 		 656 aa  212  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 709 aa  208  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  31.76 
 
 		 725 aa  206  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  26.02 
 
 		 652 aa  206  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  28.21 
 
 		 700 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  29.06 
 
 		 695 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  27.46 
 
 		 669 aa  197  9e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 573 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  33.05 
 
 		 634 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  29.65 
 
 		 578 aa  183  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  26.93 
 
 		 663 aa  183  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  31.2 
 
 		 648 aa  178  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  27.57 
 
 		 673 aa  178  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  25.36 
 
 		 637 aa  175  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  32.46 
 
 		 532 aa  170  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  27.31 
 
 		 542 aa  168  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  30.37 
 
 		 530 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  28.26 
 
 		 677 aa  162  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  31.68 
 
 		 720 aa  160  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.21 
 
 		 530 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  24.53 
 
 		 762 aa  156  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  24.53 
 
 		 762 aa  156  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  27.43 
 
 		 604 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  31.72 
 
 		 717 aa  156  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  29.6 
 
 		 536 aa  155  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 713 aa  153  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  31.72 
 
 		 322 aa  150  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  31.97 
 
 		 525 aa  150  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  31.42 
 
 		 488 aa  148  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  31.09 
 
 		 549 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  31.08 
 
 		 527 aa  145  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  27.5 
 
 		 548 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  34.15 
 
 		 624 aa  141  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  31.42 
 
 		 531 aa  141  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  33.21 
 
 		 542 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  27.78 
 
 		 524 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  29.7 
 
 		 742 aa  136  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  29.35 
 
 		 546 aa  134  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  28.16 
 
 		 670 aa  127  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  27.51 
 
 		 519 aa  119  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  25.26 
 
 		 533 aa  115  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  26.99 
 
 		 636 aa  112  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  27.01 
 
 		 484 aa  107  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  27.13 
 
 		 625 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  23.47 
 
 		 594 aa  106  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  22.11 
 
 		 614 aa  105  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 538 aa  102  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 685 aa  99.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  27.46 
 
 		 529 aa  91.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 502 aa  90.1  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  22.82 
 
 		 482 aa  89  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  25.56 
 
 		 626 aa  87.8  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  23.55 
 
 		 514 aa  85.9  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1937  hypothetical protein  26.75 
 
 		 394 aa  77.4  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314612  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  22.03 
 
 		 471 aa  73.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 		 510 aa  74.3  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  24.73 
 
 		 307 aa  70.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4599  hypothetical protein  22.84 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1181  sulfotransferase  23.75 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.902134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1180  hypothetical protein  23.29 
 
 		 281 aa  57.4  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 		 1037 aa  55.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 		 602 aa  55.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4096  sulfotransferase  25.34 
 
 		 282 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9233  hypothetical protein  25.89 
 
 		 290 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0415  hypothetical protein  23.65 
 
 		 329 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal  0.689465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3552  sulfotransferase  25 
 
 		 320 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0188645 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 598 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2481  hypothetical protein  23.75 
 
 		 269 aa  49.3  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22840  sulfotransferase  25.22 
 
 		 328 aa  48.9  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2328  sulfotransferase  21.82 
 
 		 309 aa  48.9  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 		 860 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0295  sulfotransferase  22.37 
 
 		 280 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  21.83 
 
 		 729 aa  48.1  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3867  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.35 
 
 		 967 aa  48.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 		 637 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 643 aa  47.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  23.31 
 
 		 1588 aa  47.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 448 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3108  sulfotransferase  23.67 
 
 		 370 aa  47  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2675  sulfotransferase  22.46 
 
 		 344 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.383164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 247 aa  46.6  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  23.11 
 
 		 1415 aa  46.6  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 878 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.77 
 
 		 733 aa  47  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3954  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.35 
 
 		 970 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  22.88 
 
 		 1569 aa  46.6  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1658  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 250 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.89 
 
 		 810 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.25 
 
 		 883 aa  46.2  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0295  sulfotransferase  22.22 
 
 		 280 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1207  hypothetical protein  23.27 
 
 		 336 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 1096 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2328  sulfotransferase  21.71 
 
 		 335 aa  45.8  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195926  normal  0.935915 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.11 
 
 		 557 aa  45.4  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>