More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2682 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
247 aa  500  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  74.38 
 
 
299 aa  387  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  55.33 
 
 
248 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.32 
 
 
250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58946e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1658  TPR repeat-containing protein  51.01 
 
 
250 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0433  TPR repeat-containing protein  50.6 
 
 
254 aa  249  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.017119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.13 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2020  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 
243 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  30.12 
 
 
538 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2747  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
248 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1301  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
250 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2559  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2655  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
636 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
3145 aa  82  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.43 
 
 
758 aa  80.5  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
637 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 
611 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  24.55 
 
 
820 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
612 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
614 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.91 
 
 
626 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
614 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 
602 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 
639 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.44 
 
 
626 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.35 
 
 
733 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2464  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
252 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.545805  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.44 
 
 
626 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
635 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1622  tetratricopeptide TPR_2  30.59 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
635 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
614 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.44 
 
 
614 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.44 
 
 
614 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
649 aa  75.5  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.22 
 
 
1056 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
718 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.93 
 
 
810 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.97 
 
 
1022 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.84 
 
 
561 aa  73.9  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  26.84 
 
 
561 aa  73.9  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
620 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
878 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  26.94 
 
 
577 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.07 
 
 
620 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.11 
 
 
265 aa  72  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.87 
 
 
632 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  26.48 
 
 
577 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
1094 aa  71.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
543 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
1737 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
448 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1550  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.02 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.05 
 
 
1034 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.41 
 
 
988 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
4489 aa  69.3  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
4079 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
374 aa  68.9  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
3560 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.26 
 
 
267 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
1276 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.21 
 
 
1056 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 
750 aa  68.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
3035 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.04 
 
 
818 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 
639 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.63 
 
 
1694 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
1005 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.52 
 
 
784 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
601 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 
748 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 
833 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  25.56 
 
 
676 aa  65.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.51 
 
 
689 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.81 
 
 
738 aa  65.1  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  28.99 
 
 
725 aa  64.7  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
566 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.62 
 
 
2240 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  30 
 
 
573 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
824 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 
311 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
714 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.45 
 
 
462 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
1061 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 
828 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.21 
 
 
887 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>