33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1937 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1937  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  764    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314612  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  26.15 
 
 		 889 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  23 
 
 		 899 aa  83.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 1406 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.43 
 
 		 1764 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  20.99 
 
 		 709 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  23.9 
 
 		 663 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  23.98 
 
 		 742 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.43 
 
 		 695 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  25.41 
 
 		 634 aa  60.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 713 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  25.78 
 
 		 656 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  23 
 
 		 652 aa  54.3  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  27.09 
 
 		 624 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  25.94 
 
 		 673 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  24.88 
 
 		 669 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1123  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.48 
 
 		 176 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  26.1 
 
 		 578 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 697 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  25.11 
 
 		 604 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  28.5 
 
 		 700 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  25.81 
 
 		 648 aa  47  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  27.07 
 
 		 530 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  24.24 
 
 		 762 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  24.24 
 
 		 762 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  27.94 
 
 		 542 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 619 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  23.19 
 
 		 524 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  26.57 
 
 		 677 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1611  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  37.5 
 
 		 933 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 602 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  47.62 
 
 		 667 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>