More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3097 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  100 
 
 		 933 aa  1833    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 934 aa  254  7e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  26.35 
 
 		 929 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 927 aa  189  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  25.21 
 
 		 924 aa  156  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 931 aa  155  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.21 
 
 		 935 aa  154  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 955 aa  151  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 		 944 aa  147  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.43 
 
 		 924 aa  146  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 923 aa  145  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 		 952 aa  124  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 900 aa  105  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  21.37 
 
 		 918 aa  104  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  21.66 
 
 		 892 aa  100  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.38 
 
 		 883 aa  99  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  22.94 
 
 		 937 aa  98.6  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  21.78 
 
 		 924 aa  92  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  21.41 
 
 		 940 aa  89  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  25.06 
 
 		 729 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 		 917 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  22.38 
 
 		 914 aa  82.4  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 		 3145 aa  82  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  20.66 
 
 		 917 aa  81.6  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  24.52 
 
 		 864 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  24.07 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.12 
 
 		 887 aa  78.2  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 505 aa  75.5  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 886 aa  75.5  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  26.41 
 
 		 931 aa  75.1  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 1421 aa  75.1  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  22.5 
 
 		 924 aa  74.7  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 860 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  24.06 
 
 		 586 aa  72  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 884 aa  69.3  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 873 aa  68.2  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  21.24 
 
 		 643 aa  68.2  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.9 
 
 		 3172 aa  67.8  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.91 
 
 		 810 aa  67.8  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.88 
 
 		 884 aa  67.8  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 808 aa  66.6  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.33 
 
 		 364 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 2262 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 878 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 566 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 729 aa  65.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.04 
 
 		 882 aa  65.5  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.59 
 
 		 786 aa  64.3  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  26.01 
 
 		 266 aa  64.3  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.93 
 
 		 882 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 883 aa  63.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 886 aa  63.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  19.7 
 
 		 927 aa  62.4  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  21.45 
 
 		 1067 aa  62  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.33 
 
 		 1694 aa  61.6  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  28.16 
 
 		 619 aa  61.6  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 762 aa  61.2  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.19 
 
 		 1979 aa  61.2  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 620 aa  61.2  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.97 
 
 		 2240 aa  60.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 800 aa  60.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  20 
 
 		 2059 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  32.72 
 
 		 575 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  24.28 
 
 		 587 aa  60.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 		 358 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.71 
 
 		 733 aa  59.3  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.24 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 2262 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 715 aa  59.3  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 827 aa  58.9  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 		 689 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.14 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 556 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 828 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 718 aa  58.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.24 
 
 		 725 aa  58.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.66 
 
 		 647 aa  57.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.93 
 
 		 645 aa  57.8  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 792 aa  57.4  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 4079 aa  57.4  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  27.92 
 
 		 573 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  25.66 
 
 		 1213 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 602 aa  57  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  27.27 
 
 		 321 aa  57  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25 
 
 		 837 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  21.41 
 
 		 1764 aa  57  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0116  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 207 aa  56.2  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  21.54 
 
 		 816 aa  55.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 313 aa  55.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  33.94 
 
 		 563 aa  56.2  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 607 aa  55.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.35 
 
 		 512 aa  56.2  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 362 aa  55.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.57 
 
 		 762 aa  55.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 357 aa  55.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>