196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1123 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1123  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 176 aa  356  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1902  TPR repeat-containing protein  60.42 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0551  TPR repeat-containing protein  60.42 
 
 		 188 aa  174  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0299  TPR repeat-containing protein  58.33 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0991  tetratricopeptide TPR_2  45.45 
 
 		 191 aa  148  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2352  tetratricopeptide TPR_2  47.46 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.205488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 613 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 503 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 697 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4031  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.11 
 
 		 477 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0492  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 477 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  34.07 
 
 		 762 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6145  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 477 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  34.07 
 
 		 762 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.23 
 
 		 603 aa  52  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 718 aa  51.6  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  31.96 
 
 		 560 aa  51.2  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 183 aa  50.8  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 754 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.52 
 
 		 397 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 562 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 505 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 637 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1937  hypothetical protein  27.48 
 
 		 394 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314612  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 708 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 3145 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 824 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.19 
 
 		 878 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  36.54 
 
 		 502 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 754 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 		 502 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  27.4 
 
 		 566 aa  48.5  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 		 502 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 575 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2558  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 441 aa  48.5  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  29.46 
 
 		 442 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 878 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 542 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  30.7 
 
 		 1677 aa  47.8  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 828 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.05 
 
 		 733 aa  47.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.78 
 
 		 816 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  31.07 
 
 		 550 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 909 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  28.43 
 
 		 246 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 828 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 339 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 681 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 583 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 927 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.72 
 
 		 599 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 767 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  29.63 
 
 		 780 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 1161 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 685 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 3035 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  30.39 
 
 		 725 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 444 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.93 
 
 		 1694 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  27.56 
 
 		 955 aa  45.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 284 aa  45.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 520 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 1180 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  36.76 
 
 		 111 aa  45.1  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 556 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 3172 aa  44.7  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 586 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  31.19 
 
 		 587 aa  45.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.59 
 
 		 1034 aa  45.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 713 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 280 aa  44.7  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 484 aa  44.7  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.86 
 
 		 865 aa  44.7  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 750 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0659  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 473 aa  44.7  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.574831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 714 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 234 aa  44.3  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 522 aa  44.3  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 615 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 472 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 612 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 607 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.09 
 
 		 1979 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 363 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.11 
 
 		 875 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.87 
 
 		 574 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  26.89 
 
 		 344 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  35.48 
 
 		 714 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 		 653 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 1178 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 1486 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 318 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 620 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  29.49 
 
 		 467 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  38.57 
 
 		 653 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 543 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  31.87 
 
 		 545 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 715 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>