31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0659 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0659  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 473 aa  918    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.574831 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2483  Tetratricopeptide TPR_4  64.76 
 
 		 452 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2183  tetratricopeptide TPR_2  39.71 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536833 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.95 
 
 		 573 aa  57  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 		 3301 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 927 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  32.56 
 
 		 560 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 3172 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.57 
 
 		 810 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.07 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.85 
 
 		 1694 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 713 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  28.5 
 
 		 576 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 3145 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 602 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 280 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  34.59 
 
 		 782 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  33.83 
 
 		 703 aa  46.6  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 637 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 824 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1123  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.66 
 
 		 176 aa  44.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 4079 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.43 
 
 		 816 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 566 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 245 aa  44.3  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 291 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 344 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  25 
 
 		 398 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.45 
 
 		 2240 aa  43.5  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 878 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  35.82 
 
 		 937 aa  43.1  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>