231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0551 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0551  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 188 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1902  TPR repeat-containing protein  98.94 
 
 		 188 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0299  TPR repeat-containing protein  84.57 
 
 		 188 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1123  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  60.42 
 
 		 176 aa  174  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0991  tetratricopeptide TPR_2  48.37 
 
 		 191 aa  156  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2352  tetratricopeptide TPR_2  48.67 
 
 		 201 aa  131  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.205488 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 637 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  39 
 
 		 718 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.85 
 
 		 810 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.05 
 
 		 291 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  38.82 
 
 		 685 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 543 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 878 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 291 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  43.75 
 
 		 542 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  31.48 
 
 		 430 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  30.91 
 
 		 246 aa  51.6  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 297 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  27.2 
 
 		 467 aa  51.2  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 		 505 aa  51.2  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 583 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 708 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  36.14 
 
 		 603 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.66 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 235 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 362 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 613 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 3172 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  30.77 
 
 		 816 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.48 
 
 		 865 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3714  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.68 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.4 
 
 		 397 aa  48.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 715 aa  48.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 		 247 aa  48.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  36.49 
 
 		 514 aa  48.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 681 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  59.52 
 
 		 542 aa  47.8  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  43.9 
 
 		 667 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  31.09 
 
 		 314 aa  47.8  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  27.46 
 
 		 290 aa  47.8  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 697 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 586 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 612 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.67 
 
 		 574 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 804 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 824 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  41.79 
 
 		 529 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 661 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  33.88 
 
 		 299 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4031  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 		 477 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 289 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 3145 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4301  TPR repeat-containing protein  43.1 
 
 		 361 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406426  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  34.34 
 
 		 955 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.1 
 
 		 632 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  31.68 
 
 		 1677 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 444 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  32.82 
 
 		 780 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 448 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  39.29 
 
 		 436 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 594 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 792 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  31.4 
 
 		 695 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 		 582 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  32.99 
 
 		 864 aa  45.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 739 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 909 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.09 
 
 		 560 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  38.46 
 
 		 620 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  36.46 
 
 		 502 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  38.75 
 
 		 762 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 3301 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  38.75 
 
 		 762 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 502 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 574 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 1005 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.48 
 
 		 875 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 620 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 589 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.92 
 
 		 1034 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 207 aa  45.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  34.95 
 
 		 260 aa  45.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 502 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  40.79 
 
 		 556 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 		 714 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 		 1486 aa  45.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  42.11 
 
 		 575 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0926  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 148 aa  44.7  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  39.47 
 
 		 575 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 1406 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 448 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  29.01 
 
 		 299 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 520 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  30.82 
 
 		 725 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 		 917 aa  43.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 566 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>