More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3605 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3714  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  92.97 
 
 		 185 aa  346  9e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 279 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.5 
 
 		 810 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 602 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.12 
 
 		 632 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 878 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 1276 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 1737 aa  59.3  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 927 aa  58.9  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.05 
 
 		 397 aa  58.9  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  39.77 
 
 		 714 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  34.4 
 
 		 714 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 566 aa  57.8  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  31.54 
 
 		 560 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.73 
 
 		 707 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 3560 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 594 aa  55.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.46 
 
 		 1694 aa  55.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 1005 aa  55.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 363 aa  55.1  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  33.96 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  31 
 
 		 573 aa  55.1  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  32.71 
 
 		 266 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 608 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 1252 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  30.25 
 
 		 643 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 1252 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 503 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 909 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 734 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2674  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 316 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.717454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.2 
 
 		 1034 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 708 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 4079 aa  53.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 3145 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 		 646 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 468 aa  52.4  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  32.29 
 
 		 1138 aa  52.4  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 3035 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 3172 aa  52  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  35.56 
 
 		 871 aa  52  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 448 aa  52  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1421 aa  52.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.67 
 
 		 530 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 543 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 512 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 		 315 aa  52  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  28.21 
 
 		 661 aa  51.6  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  28.93 
 
 		 436 aa  51.6  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  32.26 
 
 		 407 aa  51.6  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  31.09 
 
 		 623 aa  51.6  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 		 3301 aa  51.6  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 615 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 700 aa  51.2  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 739 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  37 
 
 		 1092 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 363 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 363 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.55 
 
 		 256 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.25 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 		 576 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  34.74 
 
 		 887 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 589 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 289 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 614 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.65 
 
 		 863 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 626 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0551  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.02 
 
 		 626 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.48 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0650389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 614 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  30.56 
 
 		 1154 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 635 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 629 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 1450 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 402 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 1091 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 614 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 614 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 614 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 542 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.37 
 
 		 676 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  30.08 
 
 		 398 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0681  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 549 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.607702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  37.12 
 
 		 1406 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  33.66 
 
 		 603 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  27.97 
 
 		 955 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 643 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 265 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 1127 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 523 aa  48.9  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 593 aa  48.9  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>