More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1759 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
207 aa  423  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2252  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 
188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0650389  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.41 
 
 
406 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.41 
 
 
406 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
878 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 
1276 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
927 aa  88.6  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  33.06 
 
 
314 aa  88.2  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.81 
 
 
237 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.71 
 
 
249 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.71 
 
 
249 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.87 
 
 
836 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.37 
 
 
730 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.46 
 
 
810 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  31.22 
 
 
560 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 
685 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.71 
 
 
1694 aa  82.4  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 
1276 aa  81.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 
523 aa  81.6  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  36.15 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  32.85 
 
 
519 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  33.99 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.09 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  33.87 
 
 
1979 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 
4489 aa  80.1  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  40.87 
 
 
635 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  40.87 
 
 
611 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  40.87 
 
 
635 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
612 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
637 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
636 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 
543 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
739 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  38.79 
 
 
681 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  34.68 
 
 
661 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
562 aa  78.6  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  34.06 
 
 
462 aa  78.6  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 
3560 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  36.03 
 
 
4079 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 
637 aa  78.2  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  37.5 
 
 
725 aa  78.6  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  33.1 
 
 
539 aa  78.6  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 
1192 aa  78.6  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
422 aa  78.2  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  32.85 
 
 
635 aa  78.2  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  38.26 
 
 
620 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
639 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  37.29 
 
 
603 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0741  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 
615 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.59 
 
 
818 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 
362 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
602 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0632  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  37.39 
 
 
620 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 
1049 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
452 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.04 
 
 
738 aa  76.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  35.14 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  34.17 
 
 
369 aa  75.5  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 
909 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 
486 aa  75.5  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  27.71 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 
632 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
1827 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  31.53 
 
 
743 aa  75.1  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.35 
 
 
707 aa  74.7  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 
265 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  35.48 
 
 
1007 aa  74.7  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
499 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 
392 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.17 
 
 
626 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 
614 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 
583 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 
716 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.17 
 
 
626 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.27 
 
 
1056 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.17 
 
 
614 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.17 
 
 
614 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.22 
 
 
784 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 
614 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
3035 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 
614 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
617 aa  74.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 
1094 aa  74.7  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>