More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1702 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
226 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  58.56 
 
 
199 aa  224  7e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2087  TPR repeat-containing protein  52.15 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000840047  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0333  TPR repeat-containing protein  46.15 
 
 
204 aa  169  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000188305  normal  0.0509123 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2046  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.63 
 
 
208 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.278718  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.78 
 
 
214 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.29 
 
 
201 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
3560 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
615 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.88 
 
 
626 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
878 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
3145 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  31.54 
 
 
887 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
620 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.04 
 
 
620 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 
614 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.85 
 
 
626 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 
614 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.85 
 
 
626 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  34.11 
 
 
614 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  34.11 
 
 
614 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 
614 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
395 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
1005 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  34.13 
 
 
577 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  34.13 
 
 
577 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
352 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
409 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 
393 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  32.77 
 
 
1979 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.3 
 
 
810 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 
639 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 
635 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 
611 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
1094 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 
635 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 
605 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.33 
 
 
733 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
718 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 
636 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.97 
 
 
689 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.65 
 
 
352 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 
884 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 
293 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 
448 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  29.29 
 
 
444 aa  62.4  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
4079 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
612 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
245 aa  61.6  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
637 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
4489 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 
3035 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
409 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
767 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3977  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
716 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  30.77 
 
 
832 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 
279 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  27.74 
 
 
1101 aa  60.1  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 
1034 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
1827 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
297 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 
543 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.46 
 
 
742 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 
1406 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
847 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
366 aa  59.3  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
567 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.16 
 
 
267 aa  58.9  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 
968 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
1212 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 
311 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.58 
 
 
207 aa  58.9  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  32.56 
 
 
573 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  27.83 
 
 
417 aa  58.5  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  29.77 
 
 
290 aa  58.2  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.34 
 
 
586 aa  58.5  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 
870 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
484 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.6 
 
 
397 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
394 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  29.01 
 
 
503 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
393 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
409 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.04 
 
 
1694 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
465 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.2 
 
 
462 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
402 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
466 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
968 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  34.12 
 
 
379 aa  56.6  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  24.66 
 
 
391 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.15 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
313 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
1104 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 
320 aa  56.6  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
377 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.46 
 
 
764 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>