More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2856 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 297 aa  597  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  71.53 
 
 		 290 aa  434  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.86 
 
 		 291 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  53.26 
 
 		 291 aa  298  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  52.08 
 
 		 297 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  52.08 
 
 		 297 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  48.96 
 
 		 288 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  48.3 
 
 		 287 aa  242  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  34.44 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.589169  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0006  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 287 aa  148  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  36.18 
 
 		 276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0006  hypothetical protein  35.19 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.62 
 
 		 1694 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1333  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0006  TPR repeat-containing protein  37.9 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  33.7 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.668643  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00051  Flp pilus assembly protein TadD  32.81 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470033 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  32.67 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  34.73 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 878 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.04 
 
 		 810 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.78 
 
 		 725 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.8 
 
 		 632 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 269 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  31.58 
 
 		 706 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 		 927 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 718 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  27.35 
 
 		 706 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 562 aa  79  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 543 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.26 
 
 		 1056 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.3 
 
 		 1056 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 649 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.88 
 
 		 1154 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.55 
 
 		 622 aa  75.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.93 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  28.87 
 
 		 560 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 697 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.09 
 
 		 764 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 3145 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 847 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.26 
 
 		 818 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.4 
 
 		 784 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.05 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.21 
 
 		 626 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.67 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 636 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 523 aa  71.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.2 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.2 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 3560 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 4489 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.77 
 
 		 988 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.89 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.84 
 
 		 875 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.29 
 
 		 576 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  25.66 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.13 
 
 		 733 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 767 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 573 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 1421 aa  69.3  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1406 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.25 
 
 		 1022 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 3035 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 750 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  25.77 
 
 		 703 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  29.25 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.92 
 
 		 820 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 594 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 587 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.88 
 
 		 561 aa  67.4  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 605 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 1192 aa  67  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 824 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.49 
 
 		 626 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 614 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 614 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.18 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  25.73 
 
 		 661 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  30.77 
 
 		 535 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.61 
 
 		 738 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 1737 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>