More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0006 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0006  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  577  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0006  TPR repeat-containing protein  71.67 
 
 
293 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  65.34 
 
 
297 aa  328  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00051  Flp pilus assembly protein TadD  44.29 
 
 
297 aa  251  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470033 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  36.56 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  34.93 
 
 
276 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0006  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 
287 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1333  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
288 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  35.46 
 
 
287 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.589169  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  36.6 
 
 
284 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.668643  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  38.93 
 
 
287 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
297 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
291 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  29.12 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  29.89 
 
 
290 aa  126  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
297 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
297 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.21 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
878 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.67 
 
 
810 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.11 
 
 
1694 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 
718 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
573 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
505 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  30.22 
 
 
699 aa  66.6  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
647 aa  67  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
1276 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
273 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 
3145 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.58 
 
 
725 aa  65.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
3035 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.39 
 
 
632 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  26.42 
 
 
391 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
3172 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
909 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  23.83 
 
 
560 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
4079 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 
366 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
860 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  28.17 
 
 
576 aa  63.5  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
293 aa  63.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 
247 aa  63.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
3301 aa  63.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 
927 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.17 
 
 
1056 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.77 
 
 
875 aa  62.4  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 
792 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
739 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  25.34 
 
 
661 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
1192 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
602 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32 
 
 
626 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.04 
 
 
373 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  31.36 
 
 
622 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 
543 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.05 
 
 
988 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
649 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
269 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 
388 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
585 aa  59.7  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 
388 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 
448 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
612 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
280 aa  59.3  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
515 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.11 
 
 
676 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 
3560 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
254 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  30.05 
 
 
648 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.15 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  20.26 
 
 
462 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
562 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 
1067 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
594 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
1421 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.42 
 
 
1154 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  31.77 
 
 
535 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  21.35 
 
 
730 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.96 
 
 
1737 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  32 
 
 
864 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 
266 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
750 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
352 aa  56.6  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  28.83 
 
 
252 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  26.09 
 
 
745 aa  56.6  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 
217 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
637 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  22 
 
 
617 aa  55.8  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.99 
 
 
637 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
290 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.1 
 
 
626 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
614 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 
635 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 
635 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.1 
 
 
614 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>