More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_00051 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  100 
 
 
284 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.668643  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  62.68 
 
 
287 aa  341  7e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0006  TPR repeat-containing protein  59.51 
 
 
287 aa  338  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  60.21 
 
 
287 aa  334  9e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.589169  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00051  Flp pilus assembly protein TadD  43.88 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0006  TPR repeat-containing protein  39.78 
 
 
293 aa  181  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1333  TPR repeat-containing protein  41.31 
 
 
288 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0006  hypothetical protein  36.6 
 
 
293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  40.89 
 
 
276 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  35.64 
 
 
297 aa  171  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 
287 aa  170  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
297 aa  148  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  29.2 
 
 
290 aa  136  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 
291 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  32.18 
 
 
288 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.13 
 
 
291 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.43 
 
 
1694 aa  79.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
448 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
3560 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 
649 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.87 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.1 
 
 
622 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.14 
 
 
725 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  30.71 
 
 
462 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 
1192 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
452 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
711 aa  63.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 
875 aa  62.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
1276 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  35.4 
 
 
820 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.74 
 
 
707 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 
4079 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 
3035 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  29.17 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  30.25 
 
 
1154 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 
465 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 
1276 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
565 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 
833 aa  59.7  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.69 
 
 
237 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 
1180 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
1094 aa  59.3  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 
573 aa  59.3  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.5 
 
 
733 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
388 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
388 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.78 
 
 
764 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 
784 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.65 
 
 
1007 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
329 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  21.67 
 
 
562 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  20.38 
 
 
1178 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 
543 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 
450 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
4489 aa  57  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 
860 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
927 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
352 aa  56.6  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
448 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.73 
 
 
385 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
739 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.8 
 
 
587 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
637 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.43 
 
 
1979 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.56 
 
 
373 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.17 
 
 
542 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 
878 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 
208 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 
1056 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  26.88 
 
 
560 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.73 
 
 
439 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.18 
 
 
458 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 
715 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.45 
 
 
564 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.13 
 
 
810 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.34 
 
 
887 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.28 
 
 
1022 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.07 
 
 
730 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.73 
 
 
439 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.25 
 
 
746 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  25.28 
 
 
661 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  22.37 
 
 
576 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.21 
 
 
383 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
3145 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.93 
 
 
988 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 
315 aa  53.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.7 
 
 
743 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  27.97 
 
 
681 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>