More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2981 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
383 aa  796    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  32.33 
 
 
299 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 
465 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 
543 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 
927 aa  96.3  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 
1276 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  24.01 
 
 
573 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
955 aa  90.5  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.41 
 
 
810 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 
1737 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 
4079 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.57 
 
 
1676 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 
878 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.17 
 
 
725 aa  86.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.06 
 
 
557 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.15 
 
 
375 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.5 
 
 
733 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
740 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.39 
 
 
784 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 
718 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  21.23 
 
 
635 aa  80.1  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.04 
 
 
1694 aa  79.7  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 
602 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.45 
 
 
448 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  22.69 
 
 
519 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 
448 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.36 
 
 
2240 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 
3145 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.18 
 
 
837 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.99 
 
 
784 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.99 
 
 
818 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 
1069 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.05 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
615 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 
824 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.71 
 
 
1056 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
1252 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
614 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.57 
 
 
626 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.57 
 
 
614 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.57 
 
 
626 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
614 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.57 
 
 
614 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.05 
 
 
689 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  24.56 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.69 
 
 
1138 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.89 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.2 
 
 
1979 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  21.36 
 
 
562 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.1 
 
 
988 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
673 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.33 
 
 
676 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 
3035 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  20.79 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  24.72 
 
 
615 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.91 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.71 
 
 
632 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 
1252 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  22.92 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  21.43 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  22.39 
 
 
706 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.25 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.63 
 
 
639 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
637 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  21.48 
 
 
1371 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
611 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.93 
 
 
620 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
635 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.88 
 
 
1022 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
635 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  24.28 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.3 
 
 
1486 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  20.62 
 
 
467 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
620 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.53 
 
 
1067 aa  70.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
883 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  22.22 
 
 
643 aa  70.1  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  22.53 
 
 
1154 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
827 aa  70.1  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.21 
 
 
745 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.13 
 
 
1056 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 
621 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
639 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 
3172 aa  69.7  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.47 
 
 
758 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 
722 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.12 
 
 
730 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.25 
 
 
936 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  22.06 
 
 
468 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  21.29 
 
 
576 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.29 
 
 
884 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 
566 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>