More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3796 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
385 aa  775    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.26 
 
 
358 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.75 
 
 
364 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.53 
 
 
363 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.53 
 
 
363 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  40.97 
 
 
227 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  37.39 
 
 
224 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1006  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 
359 aa  135  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.476893  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
1737 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
562 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.19 
 
 
810 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
878 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
1276 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 
927 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.99 
 
 
632 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 
4489 aa  107  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.47 
 
 
816 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 
4079 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.13 
 
 
397 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
3172 aa  99.8  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
1049 aa  99.8  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 
1094 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
543 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
909 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.38 
 
 
1694 aa  97.1  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  28.37 
 
 
561 aa  96.7  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
377 aa  96.3  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
761 aa  95.9  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  29.63 
 
 
564 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  28.01 
 
 
561 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
486 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.62 
 
 
725 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.14 
 
 
3301 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.46 
 
 
2240 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
635 aa  93.2  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 
602 aa  93.2  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.6 
 
 
1138 aa  92.8  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.75 
 
 
676 aa  92.8  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.57 
 
 
1979 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
1061 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
468 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  23 
 
 
681 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  30.1 
 
 
887 aa  90.5  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 
3035 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 
750 aa  89.7  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 
597 aa  89.4  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.65 
 
 
764 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
565 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.26 
 
 
622 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.49 
 
 
576 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
685 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.52 
 
 
3145 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 
448 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.99 
 
 
730 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
711 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
274 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  24.13 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
467 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
467 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.77 
 
 
818 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.78 
 
 
689 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
448 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
673 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
828 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.1 
 
 
784 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.52 
 
 
746 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  26.01 
 
 
706 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 
3560 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  27.21 
 
 
955 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.3 
 
 
732 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2863  sulfotransferase  25.76 
 
 
623 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.211639  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
828 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
847 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  23.61 
 
 
682 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.03 
 
 
340 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 
512 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 
1421 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
1486 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
892 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
739 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.15 
 
 
1067 aa  80.9  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 
767 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 
632 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 
602 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.53 
 
 
626 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26 
 
 
795 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  26.56 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.02 
 
 
784 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  21.15 
 
 
832 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  24.49 
 
 
661 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 
681 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.88 
 
 
1022 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>