198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0299 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0299  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
188 aa  370  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1902  TPR repeat-containing protein  84.57 
 
 
188 aa  315  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0551  TPR repeat-containing protein  84.57 
 
 
188 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1123  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  58.33 
 
 
176 aa  168  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0172242  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0991  tetratricopeptide TPR_2  46.45 
 
 
191 aa  155  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446124  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2352  tetratricopeptide TPR_2  45.4 
 
 
201 aa  132  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.205488 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
810 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  37 
 
 
718 aa  54.3  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  29.13 
 
 
467 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 
637 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  38.04 
 
 
505 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.66 
 
 
291 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.56 
 
 
397 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 
589 aa  51.6  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
878 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
542 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  28.87 
 
 
290 aa  51.2  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
685 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
613 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 
804 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  31.48 
 
 
430 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0486  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 
965 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  34.94 
 
 
603 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 
291 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 
586 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
714 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
583 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
444 aa  48.9  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.56 
 
 
413 aa  48.5  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2888  type IV pilus biogenesis protein PilF, putative  29.92 
 
 
255 aa  48.5  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  29.75 
 
 
529 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
362 aa  48.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  34.34 
 
 
1677 aa  48.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2117  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.15 
 
 
207 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  34.94 
 
 
615 aa  48.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 
359 aa  48.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
708 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 
314 aa  48.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 
297 aa  47.8  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.33 
 
 
574 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  28.99 
 
 
299 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 
520 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
681 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
909 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
402 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
792 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
3172 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  34.58 
 
 
725 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
968 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
250 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  32.97 
 
 
816 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  33.33 
 
 
865 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  31.18 
 
 
780 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  28.57 
 
 
437 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 
697 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  27.2 
 
 
246 aa  45.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 
503 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 
237 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
3145 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
740 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
1714 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
739 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
587 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 
661 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 
612 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  38.18 
 
 
311 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
1406 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  35.94 
 
 
514 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  34.12 
 
 
695 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.93 
 
 
196 aa  45.1  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  34.38 
 
 
502 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
502 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
754 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  32.2 
 
 
299 aa  44.7  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  31.65 
 
 
615 aa  45.1  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0936  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
388 aa  44.7  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 
808 aa  44.7  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
448 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
686 aa  44.7  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  30.93 
 
 
864 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  31.91 
 
 
585 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  31 
 
 
762 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
235 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
750 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.45 
 
 
1034 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0741  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 
1005 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  38.46 
 
 
739 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  31 
 
 
762 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  34 
 
 
714 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
502 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  33.01 
 
 
260 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
1737 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
1486 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  35.56 
 
 
436 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.76 
 
 
277 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.16 
 
 
283 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
575 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1217  putative fimbrial biogenesis and twitching motility protein  27.84 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.544829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>