138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2352 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2352  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 201 aa  403  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.205488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1123  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.46 
 
 		 176 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0991  tetratricopeptide TPR_2  40.68 
 
 		 191 aa  137  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0299  TPR repeat-containing protein  45.4 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1902  TPR repeat-containing protein  48.67 
 
 		 188 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0551  TPR repeat-containing protein  48.67 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  36.61 
 
 		 566 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 		 1180 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  43.06 
 
 		 714 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  45.07 
 
 		 505 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  43.01 
 
 		 503 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 718 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 612 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 		 616 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.41 
 
 		 863 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 377 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 546 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  35.23 
 
 		 875 aa  48.5  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  36.78 
 
 		 792 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 620 aa  48.1  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1178 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 583 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.43 
 
 		 878 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  36.11 
 
 		 436 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  40.85 
 
 		 714 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 566 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0802  tetratricopeptide TPR_2  33.14 
 
 		 362 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.47 
 
 		 574 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.95 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 1061 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  37.33 
 
 		 430 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  41.54 
 
 		 824 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  40.98 
 
 		 865 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 		 828 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 750 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 909 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 402 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.74 
 
 		 582 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1212 aa  45.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  38.82 
 
 		 739 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 739 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  32.65 
 
 		 955 aa  45.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 		 637 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  28.87 
 
 		 467 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  28.99 
 
 		 550 aa  45.1  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  32.58 
 
 		 385 aa  45.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  41.18 
 
 		 502 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 502 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  31.07 
 
 		 733 aa  44.7  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 697 aa  44.7  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 		 681 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 685 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 927 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 1451 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 766 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 448 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 937 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 833 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 828 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0054  TPR repeat-containing protein  43.86 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  35.21 
 
 		 603 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  29.75 
 
 		 780 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 754 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 1454 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 833 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 789 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 		 808 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.7 
 
 		 416 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 502 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 		 556 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  31.63 
 
 		 560 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  35.11 
 
 		 601 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  34.29 
 
 		 653 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 732 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  30.21 
 
 		 566 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3096  TPR repeat-containing protein  39.44 
 
 		 389 aa  43.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  34.34 
 
 		 269 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.84 
 
 		 807 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 1038 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 607 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 562 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  38.14 
 
 		 529 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  35.23 
 
 		 437 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 575 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  31.87 
 
 		 990 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1550  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.11 
 
 		 297 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389536  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 653 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 864 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 613 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  41.38 
 
 		 499 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  36.05 
 
 		 695 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  39.68 
 
 		 435 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 816 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  30.26 
 
 		 514 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  32.32 
 
 		 309 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 356 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>