255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4206 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 264 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  77.57 
 
 		 269 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  76.89 
 
 		 281 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  68.7 
 
 		 269 aa  358  4e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  65.87 
 
 		 290 aa  338  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  70.39 
 
 		 309 aa  331  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  61.05 
 
 		 267 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  59.51 
 
 		 279 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.6 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  52.11 
 
 		 282 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  51.89 
 
 		 282 aa  202  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  47.68 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6390  TPR repeat-containing protein  53.46 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  48.51 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  49.57 
 
 		 278 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  44.4 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  48.28 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  46.67 
 
 		 268 aa  185  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  49.01 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.98 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  46.6 
 
 		 326 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  39.67 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  38.2 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 927 aa  62.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 612 aa  61.6  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1874  sporulation related  30.62 
 
 		 541 aa  60.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138389  normal  0.137004 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.56 
 
 		 865 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.67 
 
 		 795 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  31.06 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.08 
 
 		 557 aa  57  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 542 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.33 
 
 		 545 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 595 aa  56.6  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  24.07 
 
 		 436 aa  55.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  32.69 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  32.69 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  29.67 
 
 		 587 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 566 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 324 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 573 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.7 
 
 		 732 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.31 
 
 		 883 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  27.78 
 
 		 425 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  31.73 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 465 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1676 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 511 aa  52.8  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 505 aa  52.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.6 
 
 		 810 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 415 aa  52.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.16 
 
 		 887 aa  52.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 566 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  24.89 
 
 		 619 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  26.71 
 
 		 677 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.95 
 
 		 512 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.76 
 
 		 566 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 612 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 599 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  30.91 
 
 		 440 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 393 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 681 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 878 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 610 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 473 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.63 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 685 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  25.82 
 
 		 566 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 909 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 329 aa  49.7  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 		 1737 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 251 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 522 aa  48.9  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.44 
 
 		 816 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  27.38 
 
 		 219 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  27.38 
 
 		 219 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  24.32 
 
 		 603 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1309  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  27.01 
 
 		 252 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  28.99 
 
 		 1221 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2379  hypothetical protein  29.86 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  25.32 
 
 		 395 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 614 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.75 
 
 		 626 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  28.27 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  29.21 
 
 		 572 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 572 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03066  putative cytochrome c-type biogenesis protein  30.84 
 
 		 428 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 614 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  33.91 
 
 		 648 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  34.13 
 
 		 586 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>