272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0385 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 269 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  84.09 
 
 		 290 aa  443  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  68.7 
 
 		 264 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  74.21 
 
 		 269 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  75.4 
 
 		 281 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  70.19 
 
 		 267 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  69.7 
 
 		 309 aa  324  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  60.57 
 
 		 279 aa  291  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.69 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  48.98 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  49.75 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.17 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  47.93 
 
 		 282 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  44.68 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  49.56 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  47.27 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  51.04 
 
 		 262 aa  184  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6390  TPR repeat-containing protein  48.91 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  42.74 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  46.97 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.05 
 
 		 266 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 		 273 aa  122  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  39.25 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  39.42 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  39.42 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  39.42 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  40.2 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  38.46 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.79 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  28.07 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  28.32 
 
 		 587 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1874  sporulation related  30.32 
 
 		 541 aa  58.9  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138389  normal  0.137004 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 505 aa  58.9  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 639 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 637 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 607 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.24 
 
 		 795 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 635 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 636 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 635 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 		 632 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.3 
 
 		 557 aa  57  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.13 
 
 		 816 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 612 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 543 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 767 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 611 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 927 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  24.46 
 
 		 436 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.04 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 629 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.06 
 
 		 732 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.19 
 
 		 810 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 465 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.75 
 
 		 626 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.27 
 
 		 924 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  29.38 
 
 		 623 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 4489 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 614 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  25 
 
 		 619 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.75 
 
 		 626 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.75 
 
 		 614 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.75 
 
 		 614 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 592 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 614 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 614 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 586 aa  52.8  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 909 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 542 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 393 aa  52.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 621 aa  52.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  23.85 
 
 		 955 aa  52  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 620 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 750 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 522 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  26.29 
 
 		 566 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 878 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  31.48 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 955 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  31.36 
 
 		 864 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  25.56 
 
 		 621 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 636 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.18 
 
 		 1979 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  27.53 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.73 
 
 		 626 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 573 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 448 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3977  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 716 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 		 589 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  25.56 
 
 		 621 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 511 aa  50.4  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>