60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0991 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0991  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
191 aa  380  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446124  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1902  TPR repeat-containing protein  48.37 
 
 
188 aa  157  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0551  TPR repeat-containing protein  48.37 
 
 
188 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0299  TPR repeat-containing protein  46.45 
 
 
188 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1123  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.45 
 
 
176 aa  148  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0172242  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2352  tetratricopeptide TPR_2  40.68 
 
 
201 aa  137  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.205488 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.83 
 
 
283 aa  51.6  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  32.26 
 
 
566 aa  48.5  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
297 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.68 
 
 
283 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.34 
 
 
882 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
866 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0492  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
477 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.34 
 
 
882 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
291 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0673  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.1 
 
 
283 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
613 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.2 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.69 
 
 
291 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 
917 aa  45.1  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4031  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.53 
 
 
477 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636683  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  24.14 
 
 
290 aa  45.1  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
3172 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 
1421 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 
616 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  33.75 
 
 
762 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  33.75 
 
 
762 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
4079 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  39.66 
 
 
577 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
860 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  35.71 
 
 
725 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
586 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 
1180 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
522 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
503 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
740 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3786  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.53 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.849163  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.03 
 
 
878 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2117  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.18 
 
 
207 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  30.34 
 
 
577 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  31.52 
 
 
321 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  34.29 
 
 
622 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
542 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
824 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0312  TPR repeat-containing protein  33 
 
 
293 aa  42.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.542961  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
265 aa  42  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  33.02 
 
 
703 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 
571 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  42 
 
 
898 aa  41.6  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
574 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  32.65 
 
 
955 aa  41.6  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
686 aa  41.6  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 
183 aa  41.6  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  36.59 
 
 
875 aa  41.2  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.93 
 
 
1034 aa  41.2  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
593 aa  41.6  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 
3035 aa  41.2  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 
589 aa  41.2  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.36 
 
 
582 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.351016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>