279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2048 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 283 aa  567  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  56.2 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0673  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.81 
 
 		 283 aa  275  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0312  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 		 293 aa  175  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.542961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  35.67 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  35.82 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  32.43 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 592 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  27.88 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  38.1 
 
 		 792 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  27.35 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  38.05 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.56 
 
 		 807 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2822  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 585 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.94 
 
 		 689 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.9 
 
 		 2401 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.29 
 
 		 358 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2910  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603977  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 1069 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.58 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 612 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  35.2 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 522 aa  53.9  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.13 
 
 		 375 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  32.11 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  35.2 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  35.2 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 637 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.63 
 
 		 878 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  30.14 
 
 		 271 aa  52.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 636 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 465 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.59 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  38.21 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0991  tetratricopeptide TPR_2  38.83 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 635 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 3145 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 615 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.78 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 635 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 639 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 611 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  29.2 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  29.06 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.94 
 
 		 582 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 847 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  29.5 
 
 		 619 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1897  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 		 988 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 927 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.67 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  28.47 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 931 aa  49.7  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 934 aa  49.3  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.82 
 
 		 810 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 		 923 aa  49.3  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  26.32 
 
 		 321 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  36.9 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  28.91 
 
 		 882 aa  48.9  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 614 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 804 aa  49.3  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 614 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.34 
 
 		 818 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.65 
 
 		 614 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.65 
 
 		 614 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 366 aa  48.9  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 318 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.9 
 
 		 784 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 614 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.65 
 
 		 626 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 620 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  28.84 
 
 		 395 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.65 
 
 		 626 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.3 
 
 		 884 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.46 
 
 		 626 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 587 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 968 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.1 
 
 		 1056 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.77 
 
 		 762 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.25 
 
 		 397 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 827 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 566 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1618  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>