248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3786 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3786  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 181 aa  363  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.849163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2572  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.78 
 
 		 161 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.81 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1521  hypothetical protein  55.05 
 
 		 120 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689528  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0612  tetratricopeptide TPR_2  46.9 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5130  TPR repeat-containing protein  41.51 
 
 		 175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22563 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4391  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.42 
 
 		 172 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 3145 aa  58.9  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 649 aa  59.3  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 629 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  34.02 
 
 		 395 aa  58.9  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.43 
 
 		 632 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.11 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.76 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.76 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 617 aa  56.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.79 
 
 		 820 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 1192 aa  56.6  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.97 
 
 		 818 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.21 
 
 		 1022 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 1252 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 1252 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 		 784 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 762 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 319 aa  52  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.19 
 
 		 988 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1121 aa  51.6  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 366 aa  50.8  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.59 
 
 		 1056 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 269 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 		 252 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 1276 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 467 aa  50.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.27 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 758 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 1421 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 250 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 927 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.89 
 
 		 560 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0275  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 587 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 505 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.58 
 
 		 397 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0304  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.59 
 
 		 646 aa  48.9  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.860081  normal  0.111747 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.91 
 
 		 261 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 260 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1297 aa  48.5  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0298  hypothetical protein  36.49 
 
 		 281 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0829  tetratricopeptide TPR_2  29.84 
 
 		 394 aa  48.5  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 1038 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1161 aa  48.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.89 
 
 		 850 aa  48.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 		 235 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 371 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.68 
 
 		 364 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 409 aa  47.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 270 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 3560 aa  47.8  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  30.53 
 
 		 1013 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0550  hypothetical protein  37.84 
 
 		 302 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1901  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 282 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.856329  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0990  tetratricopeptide TPR_2  36.49 
 
 		 281 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 		 1737 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.39 
 
 		 810 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 409 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 750 aa  46.6  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1276 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.16 
 
 		 730 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 		 1056 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.43 
 
 		 383 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 3301 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 594 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 544 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  21.79 
 
 		 250 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 542 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  22.32 
 
 		 745 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.42 
 
 		 707 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 699 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1722  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  28.89 
 
 		 452 aa  45.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2390  tetratricopeptide TPR_2  31.48 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  32.05 
 
 		 643 aa  45.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 266 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1122  tetratricopeptide region  39.19 
 
 		 283 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124887  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 315 aa  45.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 589 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.19 
 
 		 689 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 270 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  29.27 
 
 		 581 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 245 aa  45.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1590  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 294 aa  45.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 1450 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  30.33 
 
 		 412 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2098  tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein  25.23 
 
 		 653 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.903394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 568 aa  45.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 543 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>