More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4031 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4031  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 477 aa  981    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0492  TPR repeat-containing protein  89.31 
 
 		 477 aa  872    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6145  TPR repeat-containing protein  92.45 
 
 		 477 aa  897    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 767 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 878 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 1737 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.57 
 
 		 810 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 4489 aa  74.3  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.57 
 
 		 1694 aa  70.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.1 
 
 		 632 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 		 713 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 3301 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.49 
 
 		 875 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 3035 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 1085 aa  67.4  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.64 
 
 		 626 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.79 
 
 		 626 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 614 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 		 505 aa  67  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 614 aa  67  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.79 
 
 		 614 aa  67  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 614 aa  67  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 486 aa  67  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.79 
 
 		 614 aa  67  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 		 1486 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  27.61 
 
 		 641 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 3172 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  30.82 
 
 		 2679 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 637 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  28.93 
 
 		 560 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 3560 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  29 
 
 		 650 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.64 
 
 		 1154 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  27.4 
 
 		 780 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.43 
 
 		 865 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 		 4079 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.58 
 
 		 626 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.56 
 
 		 739 aa  63.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.28 
 
 		 887 aa  63.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 754 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  24.69 
 
 		 682 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.01 
 
 		 764 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  25.16 
 
 		 676 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 620 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  32.95 
 
 		 703 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1276 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 543 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.41 
 
 		 725 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.61 
 
 		 620 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 754 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.39 
 
 		 603 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1094 aa  61.6  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.62 
 
 		 836 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 909 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.84 
 
 		 565 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  25 
 
 		 661 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 718 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 635 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.87 
 
 		 742 aa  60.1  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.94 
 
 		 622 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 635 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.12 
 
 		 795 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 2651 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.75 
 
 		 1056 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  29.45 
 
 		 648 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 250 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 979 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.33 
 
 		 739 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 		 714 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.48 
 
 		 863 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 611 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 740 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1038 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 927 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.56 
 
 		 689 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 686 aa  57.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 750 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.98 
 
 		 818 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.82 
 
 		 745 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 589 aa  57.4  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 573 aa  57.4  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  33.33 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  23.33 
 
 		 436 aa  57  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 860 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 612 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 344 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 955 aa  56.6  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>