More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2755 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
234 aa  481  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 
927 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
878 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.12 
 
 
397 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.16 
 
 
810 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
543 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 
356 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
576 aa  102  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.06 
 
 
1694 aa  102  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
280 aa  101  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 
1276 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.85 
 
 
573 aa  99.4  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 
1094 aa  97.8  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  32.46 
 
 
560 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.9 
 
 
730 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
4079 aa  95.9  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.05 
 
 
707 aa  95.5  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  30.62 
 
 
314 aa  95.1  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
366 aa  94.4  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
602 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
562 aa  93.2  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.23 
 
 
1022 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
465 aa  92  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.09 
 
 
626 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.09 
 
 
614 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.09 
 
 
614 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 
614 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 
632 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  30.2 
 
 
1138 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 
614 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.09 
 
 
626 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 
614 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
243 aa  90.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.47 
 
 
784 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.18 
 
 
1056 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.21 
 
 
1056 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.63 
 
 
620 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 
4489 aa  88.2  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
1069 aa  87.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.53 
 
 
626 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
1276 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
3035 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.18 
 
 
988 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
3145 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  30.25 
 
 
833 aa  85.5  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
620 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  28.72 
 
 
545 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 
639 aa  85.1  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  28.72 
 
 
587 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  27.7 
 
 
623 aa  85.1  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  27.27 
 
 
391 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
589 aa  84.7  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
612 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
636 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  31.03 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.74 
 
 
708 aa  83.6  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.69 
 
 
1979 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
635 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
635 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 
754 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.13 
 
 
725 aa  82  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
3560 aa  82.4  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
1827 aa  81.6  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
556 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
375 aa  81.6  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.87 
 
 
818 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
512 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  26.02 
 
 
561 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.63 
 
 
784 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
611 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 
711 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
637 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3141  tetratricopeptide TPR_2  25.12 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00286611  normal  0.0160397 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
955 aa  80.1  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 
1192 aa  80.1  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
435 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 
471 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.94 
 
 
745 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28 
 
 
820 aa  79.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
374 aa  79  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
1049 aa  79  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
615 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
740 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  33.17 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
363 aa  78.6  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.51 
 
 
561 aa  78.6  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
750 aa  78.2  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.67 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.7 
 
 
695 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
523 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.67 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
662 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.23 
 
 
1007 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>