More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0720 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.51 
 
 		 149 aa  95.1  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0957  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 161 aa  90.1  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000843973  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0636  TPR repeat-containing protein  41.07 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.435479  normal  0.935135 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 		 878 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.12 
 
 		 810 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  43.82 
 
 		 923 aa  68.6  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  32.58 
 
 		 299 aa  68.2  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1103  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.6 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0923259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.2 
 
 		 1022 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  30.3 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 718 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 1056 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.97 
 
 		 632 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 1486 aa  62  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 754 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.37 
 
 		 882 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.37 
 
 		 882 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.73 
 
 		 875 aa  60.1  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 593 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  28.78 
 
 		 550 aa  59.7  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 3172 aa  58.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 860 aa  58.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 762 aa  58.2  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.8 
 
 		 571 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 392 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.06 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 673 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.06 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  28.47 
 
 		 1213 aa  55.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 654 aa  55.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.97 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.06 
 
 		 988 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 1737 aa  55.1  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 754 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36889  predicted protein  31.37 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00688126  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  32.99 
 
 		 681 aa  55.1  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.03 
 
 		 1056 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  29.32 
 
 		 832 aa  54.7  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  29.55 
 
 		 585 aa  54.3  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  29.53 
 
 		 266 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 739 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 565 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 927 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.89 
 
 		 352 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.85 
 
 		 267 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1676 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 375 aa  54.3  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 468 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.61 
 
 		 582 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 828 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4040  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 394 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 274 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 1421 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  32.09 
 
 		 936 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.22 
 
 		 1979 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0120  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 555 aa  52.4  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.51724  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 409 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.71 
 
 		 614 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.71 
 
 		 626 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 614 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.99 
 
 		 308 aa  52.4  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 827 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.16 
 
 		 626 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.08 
 
 		 689 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 614 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.71 
 
 		 614 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 409 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 828 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 589 aa  52  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.71 
 
 		 626 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 934 aa  52  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 614 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0100  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 375 aa  51.6  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4485  transcriptional regulator, CadC  29.05 
 
 		 520 aa  51.6  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 808 aa  51.6  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.07 
 
 		 274 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 		 3301 aa  51.6  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.18 
 
 		 818 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.18 
 
 		 784 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 274 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 792 aa  51.2  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 615 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 1069 aa  50.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.15 
 
 		 622 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2131  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 395 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  32.82 
 
 		 937 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0082  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.146117  hitchhiker  0.00321946 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1622  tetratricopeptide TPR_2  30.43 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 1406 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 3145 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 802 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 639 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>