More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0362 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 149 aa  299  7.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.51 
 
 		 186 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0957  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 161 aa  89.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000843973  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.88 
 
 		 565 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 		 878 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 927 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1103  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.81 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0923259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  37.11 
 
 		 3301 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 3172 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  29.03 
 
 		 321 aa  63.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.84 
 
 		 810 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  31.19 
 
 		 267 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.7 
 
 		 1764 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.75 
 
 		 199 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 605 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.81 
 
 		 1022 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 291 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.08 
 
 		 632 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.58 
 
 		 715 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  32.08 
 
 		 936 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 3145 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  36.79 
 
 		 582 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 3560 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  34.21 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  40 
 
 		 577 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.3 
 
 		 542 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  29.66 
 
 		 1013 aa  57.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.19 
 
 		 308 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.65 
 
 		 668 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  33.04 
 
 		 764 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.07 
 
 		 875 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 288 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 263 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 739 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 1421 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 1737 aa  57.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  29.31 
 
 		 682 aa  57.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 589 aa  57  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 648 aa  57  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 291 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.82 
 
 		 263 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  32.26 
 
 		 837 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  33.91 
 
 		 539 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  31.73 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  38.95 
 
 		 577 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 		 818 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1049 aa  57  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.11 
 
 		 2240 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  33.01 
 
 		 622 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 847 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 909 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 883 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 573 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 750 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 589 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0636  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.435479  normal  0.935135 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0344  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 748 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 468 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 543 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 1121 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0330  tetratricopeptide repeat domain protein  34.85 
 
 		 931 aa  54.3  0.0000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.905094  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 750 aa  54.7  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 568 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 1252 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 363 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.92 
 
 		 1056 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 289 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 1252 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 409 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  35.58 
 
 		 334 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1535  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.46 
 
 		 251 aa  53.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.500528  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0006  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 293 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  29.46 
 
 		 729 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 713 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.42 
 
 		 836 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.16 
 
 		 620 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 1406 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4040  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 226 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  29.55 
 
 		 1154 aa  52.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 		 1486 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.36 
 
 		 988 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 762 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 780 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  34.62 
 
 		 462 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 329 aa  52.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  37.63 
 
 		 706 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 670 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.85 
 
 		 784 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 615 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 265 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>