81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1103 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1103  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 189 aa  381  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0923259 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0636  TPR repeat-containing protein  61.7 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.435479  normal  0.935135 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0957  TPR repeat-containing protein  38.61 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000843973  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.41 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.6 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 601 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  33.04 
 
 		 314 aa  52  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  37.84 
 
 		 594 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 681 aa  51.2  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 602 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 637 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  38.3 
 
 		 585 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0733  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  32.85 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 643 aa  48.9  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.82 
 
 		 354 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  32 
 
 		 1213 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 824 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  40.7 
 
 		 682 aa  48.5  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 685 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 909 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3321  TPR repeat-containing protein  40.86 
 
 		 453 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 		 1737 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 587 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1430  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.08 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.14258  normal  0.202712 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  32.67 
 
 		 603 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.96 
 
 		 810 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0047  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 506 aa  45.8  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0614925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2131  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 265 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  34.31 
 
 		 780 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3465  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.78 
 
 		 451 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0563364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 878 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.54 
 
 		 416 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.91 
 
 		 795 aa  45.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3401  Tetratricopeptide TPR_4  39.78 
 
 		 453 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0349174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  40 
 
 		 482 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 860 aa  44.7  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 750 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 3145 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 750 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0991  tetratricopeptide TPR_2  28.95 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 573 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 776 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1250  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  32.79 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.901782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  36.28 
 
 		 593 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  42.31 
 
 		 686 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  32.14 
 
 		 764 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  31.73 
 
 		 733 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 804 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 		 362 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1301  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 638 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 		 536 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 748 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 1252 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 1252 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 597 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  27.87 
 
 		 638 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 339 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 767 aa  42  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 		 817 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 229 aa  42  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2492  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.62 
 
 		 441 aa  42  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 847 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  34.15 
 
 		 246 aa  41.6  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0299  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3751  tetratricopeptide TPR_2  31 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87227  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  34.15 
 
 		 676 aa  41.6  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 		 1106 aa  41.2  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  34.02 
 
 		 463 aa  41.2  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 		 632 aa  41.6  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2907  Tetratricopeptide domain protein  36.51 
 
 		 722 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2723  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 723 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.55 
 
 		 639 aa  41.2  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  27.2 
 
 		 569 aa  41.2  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  33.62 
 
 		 864 aa  41.2  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3385  TPR repeat-containing protein  39.78 
 
 		 427 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.981404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2815  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.51 
 
 		 727 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1291  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.03 
 
 		 249 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0420  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.03 
 
 		 249 aa  40.8  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209508 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 3172 aa  41.2  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>