222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2131 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2131  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 265 aa  544  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0979  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 330 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0547442  normal  0.0871069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1821  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.103066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2024  hypothetical protein  26.89 
 
 		 373 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2026  tetratricopeptide TPR_4  25.5 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1593  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.62 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 632 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1557  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  26.13 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 878 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.39 
 
 		 810 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.47 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  25.63 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  25.63 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  25.63 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  25.63 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  25.63 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  25.63 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.93 
 
 		 1154 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3954  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.93 
 
 		 970 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3867  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.93 
 
 		 967 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3810  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 969 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.324215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 3172 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3930  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 974 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 808 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 615 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 420 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 522 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  19.77 
 
 		 1486 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.35 
 
 		 837 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 563 aa  53.9  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0942  tetratricopeptide TPR_4  34.26 
 
 		 765 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.799869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 522 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.26 
 
 		 875 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  29.29 
 
 		 208 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  20.66 
 
 		 676 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 944 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  30.46 
 
 		 677 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.57 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 620 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 357 aa  53.1  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 804 aa  52.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1676 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 637 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 357 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.26 
 
 		 689 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 681 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 685 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 583 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 927 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 792 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 750 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.14 
 
 		 370 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  24.1 
 
 		 603 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1711  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 520 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1677  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  23.35 
 
 		 594 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.22 
 
 		 725 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1422  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.27 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.162088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0873  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 483 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0633299  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.5 
 
 		 1737 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 		 1061 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0741  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 191 aa  49.3  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.55 
 
 		 620 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  34.12 
 
 		 442 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  20.51 
 
 		 352 aa  49.3  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  28.57 
 
 		 661 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 748 aa  49.3  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 718 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 3145 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 824 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 589 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 561 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.89 
 
 		 736 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.56 
 
 		 557 aa  48.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 448 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 1178 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 643 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.43 
 
 		 1034 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 		 3301 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3236  tetratricopeptide TPR_4  27.55 
 
 		 514 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.789976  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 789 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.68 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0237  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 		 984 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.08 
 
 		 668 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  34.38 
 
 		 444 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 466 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2578  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 577 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0632  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 198 aa  46.2  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>