28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0237 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0237  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 984 aa  1955    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3954  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.58 
 
 		 970 aa  64.3  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3810  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 969 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.324215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1821  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 330 aa  55.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.103066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2131  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 265 aa  54.7  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 697 aa  54.7  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3930  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 974 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 250 aa  53.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0939  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.2 
 
 		 753 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0936  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.2 
 
 		 754 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.563253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0942  tetratricopeptide TPR_4  31.58 
 
 		 765 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.799869 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 828 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0888  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 761 aa  48.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527607  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3768  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 299 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 4079 aa  47.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  28.63 
 
 		 601 aa  47  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.3 
 
 		 257 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.84 
 
 		 810 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.5 
 
 		 3145 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0915  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 324 aa  46.2  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051049 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 866 aa  46.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1557  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.59 
 
 		 390 aa  46.2  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.45 
 
 		 389 aa  45.8  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  37.38 
 
 		 208 aa  45.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2037  hypothetical protein  35.23 
 
 		 154 aa  45.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0732088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.47 
 
 		 267 aa  45.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 748 aa  44.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.79 
 
 		 807 aa  45.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>