66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1821 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1821  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 330 aa  668    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.103066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0979  TPR repeat-containing protein  43.07 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0547442  normal  0.0871069 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2024  hypothetical protein  36.55 
 
 		 373 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1557  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.36 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1593  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.21 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2026  tetratricopeptide TPR_4  35.06 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2131  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  61.22 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1676 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1912  tetratricopeptide TPR_4  26.15 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.699015  normal  0.478041 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1319  hypothetical protein  26.4 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194726  hitchhiker  0.00472104 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3954  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 970 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.21 
 
 		 1764 aa  53.1  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3930  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 974 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  29.29 
 
 		 208 aa  53.1  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0237  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.23 
 
 		 984 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 357 aa  52.8  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3810  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 969 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.324215  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.46 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3867  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 967 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  30.09 
 
 		 594 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 3172 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  31.13 
 
 		 837 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.09 
 
 		 810 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 878 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3799  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 691 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487228 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1134  hypothetical protein  25.64 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 722 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 2240 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0942  tetratricopeptide TPR_4  27.69 
 
 		 765 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.799869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3395  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.46 
 
 		 652 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105857  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.95 
 
 		 725 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  29.7 
 
 		 562 aa  47.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.59 
 
 		 733 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.81 
 
 		 632 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 265 aa  46.6  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0888  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 761 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 344 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0936  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.23 
 
 		 754 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.563253  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  31.25 
 
 		 704 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0939  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.23 
 
 		 753 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 344 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.07 
 
 		 267 aa  46.2  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  30.97 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 827 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 750 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.96 
 
 		 689 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 718 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 697 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  25.66 
 
 		 725 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  27.08 
 
 		 673 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.8 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0257  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 431 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  26.34 
 
 		 550 aa  43.5  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  26 
 
 		 648 aa  42.7  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.52 
 
 		 865 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 363 aa  42.7  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 3145 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  27.35 
 
 		 931 aa  42.7  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 254 aa  42.7  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 274 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 265 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 448 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>