121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3810 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3810  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
969 aa  1746    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.324215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3954  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  93.51 
 
 
970 aa  1259    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3867  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  93.09 
 
 
967 aa  1241    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3930  TPR repeat-containing protein  63.53 
 
 
974 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.18 
 
 
810 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.71 
 
 
632 aa  68.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  45.16 
 
 
667 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.21 
 
 
358 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
566 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
878 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  31.8 
 
 
545 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  38.94 
 
 
620 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
3172 aa  62  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
968 aa  60.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 
620 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0257  TPR repeat-containing protein  43.75 
 
 
431 aa  60.1  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447691  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
402 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 
766 aa  59.7  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 
1297 aa  58.9  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
265 aa  58.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  29.11 
 
 
729 aa  58.2  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.93 
 
 
875 aa  58.2  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 
847 aa  57.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2131  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 
265 aa  57  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  37.78 
 
 
614 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.23 
 
 
1676 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.31 
 
 
622 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  37.78 
 
 
614 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 
614 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  37.78 
 
 
626 aa  56.2  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  37.78 
 
 
626 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.81 
 
 
626 aa  56.2  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 
614 aa  56.2  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  30.48 
 
 
690 aa  56.2  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
689 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
767 aa  55.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 
614 aa  55.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 
2262 aa  55.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 
934 aa  55.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
2262 aa  55.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.85 
 
 
2240 aa  54.7  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
808 aa  54.7  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.21 
 
 
1056 aa  54.7  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
1406 aa  53.9  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
827 aa  53.9  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  22.49 
 
 
561 aa  54.3  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
690 aa  54.3  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2024  hypothetical protein  30.66 
 
 
373 aa  53.5  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2071  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  30.5 
 
 
314 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.209894  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
448 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  30.33 
 
 
535 aa  53.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 
616 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 
274 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6484  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.83 
 
 
1257 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 
883 aa  52.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.49 
 
 
352 aa  53.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 
505 aa  52.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.86 
 
 
340 aa  52.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 
1178 aa  52  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  34.56 
 
 
883 aa  52  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  29.77 
 
 
573 aa  51.6  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1821  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
330 aa  51.6  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.103066  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  41.59 
 
 
927 aa  51.2  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  32.17 
 
 
864 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  30.22 
 
 
436 aa  51.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0979  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
330 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0547442  normal  0.0871069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3430  hypothetical protein  34.29 
 
 
695 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112777  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 
289 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.95 
 
 
1056 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
744 aa  50.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  26.56 
 
 
574 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.95 
 
 
818 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 
748 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.59 
 
 
988 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  31.79 
 
 
612 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  31.72 
 
 
695 aa  49.3  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.65 
 
 
545 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 
602 aa  49.3  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.84 
 
 
359 aa  48.9  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0406  Tetratricopeptide TPR_4  42.11 
 
 
321 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0861646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
718 aa  48.9  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.56 
 
 
884 aa  48.9  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.95 
 
 
784 aa  48.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
952 aa  48.1  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.13 
 
 
917 aa  48.1  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  27.76 
 
 
575 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 
556 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
601 aa  47.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2298  tetratricopeptide TPR_2  34.02 
 
 
664 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  33.09 
 
 
444 aa  47.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
955 aa  47.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 
884 aa  47.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 
715 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
789 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.67 
 
 
804 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0074  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.11 
 
 
967 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.33 
 
 
384 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
886 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.08 
 
 
639 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 
697 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>