15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2071 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2071  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  100 
 
 		 314 aa  624  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.209894  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1319  hypothetical protein  46.27 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194726  hitchhiker  0.00472104 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0406  Tetratricopeptide TPR_4  44.38 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0861646 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1195  hypothetical protein  51.49 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0974487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1912  tetratricopeptide TPR_4  31.4 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.699015  normal  0.478041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1134  hypothetical protein  25.8 
 
 		 250 aa  93.2  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3810  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 969 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.324215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3954  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.79 
 
 		 970 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3867  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.57 
 
 		 967 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0979  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0547442  normal  0.0871069 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0257  TPR repeat-containing protein  49.02 
 
 		 431 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1821  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.103066  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3930  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 974 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  43.42 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2024  hypothetical protein  37.04 
 
 		 373 aa  42.4  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>